Joensuun Puhallinorkesterin hallinnosta, toiminnan suunnittelusta ja käytännön asioiden hoidosta vastaa yhdistyksen vuosikokouksen valitsema johtokunta. Siihen kuuluu puheenjohtaja sekä neljä varsinaista ja kaksi varajäsentä. Jäsenten toimikausi on kaksi vuotta siten, että puolet heistä on kunakin vuonna erovuorossa. Myös orkesterin kapellimestari osallistuu johtokunnan toimintaan.
Joensuun Puhallinorkesteriyhdistys ry:n johtokunta vuonna 2015:
Puheenjohtaja Erkki Kettunen, 0500 139 750, erkkikettu@gmail.com
Sihteeri Annikki Tanskanen, 050 414 3475 mstanskanen@gmail.com
Kapellimestari Mika Hirvonen, 050 556 5221, mika.hirvonen@jns.fi
Muut jäsenet
Anna Dannenberg, jäsen
Jukka Tuunanen jäsen, varapuheenjohtaja
Kaisa Tanskanen, jäsen
Kurt Westerberg, varajäsen
Maria Aukee, varajäsen
